W 1916r. powstało w Zamościu Prywatne Gimnazjum Realne Żeńskie. W 1918r. Gimnazjum przeszło pod kuratelę Polskiej Macierzy Szkolnej. Utworzył się pierwszy zrąb księgozbioru. W połowie lat dwudziestych księgozbiór liczył już około 1400 książek, a w latach trzydziestych ponad 6 tys. tomów. Przy bibliotece funkcjonowała czytelnia czasopism dla nauczycieli i uczniów. W 1939r. majątek szkoły został zdeponowany w Muzeum Zamojskim. W 1944r. szkoła wznowiła swoją działalność. Młodzież II Liceum korzystała z biblioteki wspólnej z I Liceum im. J. Zamoyskiego. Był to po wojnie pierwszy w Zamościu księgozbiór liczący 15 tys. woluminów. Księgozbiór biblioteki sukcesywnie zwiększał swoją liczebność.

W 1965r. roku nastąpiło przeniesienie Liceum do nowego budynku. Księgozbiory wspólnej biblioteki I i II Liceum zostały rozdzielone. Biblioteka jako samodzielna jednostka rozwijała swoją bazę lokalową oraz powiększała księgozbiór. W 1993 r. biblioteka powiększyła się o księgozbiór Liceum dla Dorosłych. Połączone księgozbiory zostały rozdysponowane do trzech pomieszczeń. Już we wrześniu rozpoczęła swą pracę wypożyczalnia szkolna. W październiku 1993r. miało miejsce otwarcie czytelni. W maju 1994 r. ukończono porządkowanie magazynu bibliotecznego.

Od 1995 r. pracownicy biblioteki zaczęli wdrażać plan jej uwidocznienia w szkole poprzez:
- organizację konkursów dla uczniów ("Z antykiem za pan brat", "ABC wiedzy o książce",
"Juliusz Słowacki", "Henryk Sienkiewicz")
- organizację spotkań z pisarzami, poetami i ludźmi kultury regionu (Jan Sztern, Barbara Rybałtowska,
Maria Duławska, Leszek Wójtowicz, ks. Krzysztof Guzowski)
- gazetki propagujące literaturę piękną, poezję regionalną czy poświęcone wielkim pisarzom polskim
i światowym
- organizację lekcji bibliotecznych w: Bibliotece Uniwersytetu Marii Curie Skłodowskiej w Lublinie,
Bibliotece Politechniki Lubelskiej, Bibliotece Pedagogicznej w Zamościu, Bibliotece Publicznej
w Zamościu.

W 2003 r. czytelnia szkolna wzbogaciła się o 4 stanowiska komputerowe z dostępem do Internetu, a dwa lata później o kolejne 4.

Obecnie wypożyczalnia znajduje się w sali nr 3 (parter), zaś czytelnia w sali nr 19 ( I piętro). W dniu 01.01.2006 r. Biblioteka II Liceum liczyła 26620 jednostek: książek, broszur, atlasów, kaset.

W czasach komputerów i dvd - chcąc dotrzeć do czytelników - bibliotekarz musi ich zainteresować i "zaprosić" do biblioteki poprzez:
- konkursy, wymagające od ucznia poszukiwania informacji w książkach, czasopismach i Internecie,
- wystawki książek i gazetki poświęcone Laureatom Literackiej Nagrody Nobla, współczesnym pisarzom polskim, poetom regionu,
- gazetki zachęcające do czytania książek (opisy tytułów, które spodobały się uczniom i polecają je swoim koleżankom i kolegom),
- rozmowy o książkach podczas lekcji bibliotecznych,
- uzupełnianie księgozbioru o książki ciekawe i nowe.